RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 FUT6P51993 359 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ART1P52961 327 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP1B3P54709 279 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 GNG3P63215 75 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF154Q13106 437 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF529Q6P280 563 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SATL1Q86VE3 508 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM168AQ92567 244 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 RFT1Q96AA3 541 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 YIPF6Q96EC8 236 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 BORCS8Q96FH0 119 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51E2Q9H255 320 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51I2Q9H344 312 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 STUB1Q9UNE7 303 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-208ENST00000463533 PDZD2O15018 2839 aa7.09□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 LRP5LA4QPB2 252 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5B21A6NL26 309 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM210A6NLX4 147 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEB3O15480 346 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 SYNGR1O43759 233 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 RP2O75695 350 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 RHBDL1O75783 438 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF205O95201 554 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 TFAP2AP05549 437 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 HCKP08631 526 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 UCHL1P09936 223 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 SRMP19623 302 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 BDKRB2P30411 391 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 HAAOP46952 286 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 ALDH3B2P48448 385 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 POU3F4P49335 361 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 PDLIM4P50479 330 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 MTCP1P56278 107 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 GMFBP60983 142 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP3R1P63098 170 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 HFEQ30201 348 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 Q5PR19 223 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM201AQ5SY85 155 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 C22orf42Q6IC83 251 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 CALHM1Q8IU99 346 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 BATF2Q8N1L9 274 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC29Q8WV35 223 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF141Q8WVD5 230 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 AQP3Q92482 292 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 TECTBQ96PL2 329 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXC2Q99958 501 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 CKLFQ9UBR5 152 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 SSR3Q9UNL2 185 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 SHISA3A0PJX4 238 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM178BH3BS89 294 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT9BO14905 357 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 AKR7A2O43488 359 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 ALDOBP05062 364 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 IRF2P14316 349 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-208ENST00000463533 EGR1P18146 543 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms