RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445369.2

CLDN9-201, Transcript of claudin 9, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN9, Length 2,050 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9-201ENST00000445369 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 GLRA1P23415 457 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PCBD1P61457 104 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ASCL4Q6XD76 172 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DCUN1D4Q92564 292 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 TMEM45BQ96B21 275 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 RGCCQ9H4X1 137 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 LRFN1Q9P244 771 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DUX4Q9UBX2 424 aa15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 H0YIZ8 118 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 LGALS8O00214 317 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 JMJD7P0C870 316 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PGAM2P15259 253 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 RSU1Q15404 277 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SPINK14Q6IE38 97 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SKA3Q8IX90 412 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 HSF4Q9ULV5 492 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 MPTX1A8MV57 137 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 TERTO14746 1132 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 KCNAB3O43448 404 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 CSTBP04080 98 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 LYL1P12980 280 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 RBP2P50120 134 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 CCDC157Q569K6 752 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SLC38A6Q8IZM9 456 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 BORCS8Q96FH0 119 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DNTTIP1Q9H147 329 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 FRYLO94915 3013 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 F8VVB4 439 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 F8VWA3 439 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 NRASP01111 189 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ECI1P42126 302 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 FAM3AP98173 230 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 TAF9Q16594 264 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 GLRX5Q86SX6 157 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 STOML3Q8TAV4 291 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SHARPINQ9H0F6 387 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 COQ3Q9NZJ6 369 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 EDARQ9UNE0 448 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 LINC01387J3KSC0 135 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 M0R296 226 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 NEURL1O76050 574 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PLATP00750 562 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PTGER4P35408 488 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF92Q03936 586 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 OR8B8Q15620 311 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 OR2M7Q8NG81 312 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 OR10C1Q96KK4 312 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DECR2Q9NUI1 292 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 AK3Q9UIJ7 227 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 CHATP28329 748 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 NRN1LQ496H8 165 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 MICU1Q9BPX6 476 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 IGKV1D-12P01611 117 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 EDN3P14138 238 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 DTYMKP23919 212 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 IL15RAQ13261 267 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN9-201ENST00000445369 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms