RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428343.5

RFX8-201, Transcript of RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RFX8, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8-201ENST00000428343 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.69□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 J3QT63 122 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 WNT9BO14905 357 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CALCBP10092 127 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 MYL9P24844 172 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CD80P33681 288 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 GPR107Q5VW38 600 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 C1orf87Q8N0U7 546 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 SEH1LQ96EE3 360 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TIMD4Q96H15 378 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CENPOQ9BU64 300 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TLNRD1Q9H1K6 362 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ALX3O95076 343 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CYB5AP00167 134 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 EGR1P18146 543 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ADRA2CP18825 462 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 OR3A4PP47883 348 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ALDH3B2P48448 385 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TMEM33P57088 247 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 OR51F2Q8NH61 342 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 Q8TCH9 128 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PHYHIPQ92561 330 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 RAB1CQ92928 201 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ING4Q9UNL4 249 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 WIPI2Q9Y4P8 454 aa11.68□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TRIM64BA6NI03 449 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CSF3P09919 207 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 GALP22466 123 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 GLRA1P23415 457 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TGFBR1P36897 503 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 DSCR9P59020 149 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 MXD1Q05195 221 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 RIN1Q13671 783 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 SHEQ5VZ18 495 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 KCTD7Q96MP8 289 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CNTD2Q9H8S5 307 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 NPTNQ9Y639 398 aa11.67□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 SHISA3A0PJX4 238 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PPIAL4DF5H284 164 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 IFNL4K9M1U5 179 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 NXPH2O95156 264 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CDRT1O95170 752 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ALDOBP05062 364 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 NPBWR2P48146 333 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 SNU13P55769 128 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 BTG1P62324 171 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 IL24Q13007 206 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ZMYND11Q15326 602 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ZNF181Q2M3W8 571 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 MKXQ8IYA7 352 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 S100A13Q99584 98 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PKIBQ9C010 78 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 DYSFO75923 2080 aa11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 MEGF11A6BM72 1044 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 RNF223E7ERA6 249 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 F8VVB4 439 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 F8VWA3 439 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 NDUFS8O00217 210 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 BCL3P20749 454 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PTGFRP43088 359 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 OR10A3P58181 314 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 ZP1P60852 638 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 VBP1P61758 197 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CRIP3Q6Q6R5 217 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RFX8-201ENST00000428343 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms