RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 SYNGR1O43759 233 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 UBE2E1P51965 193 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 KRTAP10-3P60369 221 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 ACTR3P61158 418 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 CLVS2Q5SYC1 327 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 BCL2L15Q5TBC7 163 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 GID4Q8IVV7 300 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 CD177Q8N6Q3 437 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 TMEM185AQ8NFB2 350 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 OR51G2Q8NGK0 314 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 OR14K1Q8NGZ2 314 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 LINC01006Q8NI28 216 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 CITED1Q99966 193 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 GPR173Q9NS66 373 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 SNX5Q9Y5X3 404 aa22.28■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 RFPL4AA6NLU0 287 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 DLGAP1O14490 977 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 PGA5P0DJD9 388 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 HAAOP46952 286 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 NCR3LG1Q68D85 454 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 HCP5Q6MZN7 132 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 CIB1Q99828 191 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 SLC22A13Q9Y226 551 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 RNF114Q9Y508 228 aa22.27■■□□□ 1.16
LMO1-202ENST00000428101 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa22.26■■□□□ 1.15
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LMO1-202ENST00000428101 A6NIN4 97 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 J3QT63 122 aa22.26■■□□□ 1.15
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LMO1-202ENST00000428101 SAA4P35542 130 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 C1orf146Q5VVC0 180 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 ZNF573Q86YE8 665 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 C19orf12Q9NSK7 152 aa22.26■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 MEIOCA2RUB1 952 aa22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 RASSF2P50749 326 aa22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 SMIM21Q3B7S5 101 aa22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 Q6ZSV7 163 aa22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 TBX5Q99593 518 aa22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 VPREB3Q9UKI3 123 aa22.25■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 ATP5HO75947 161 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 RPP14O95059 124 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 CCL1P22362 96 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 PRDX2P32119 198 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 PROK1P58294 105 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 ACSM1Q08AH1 577 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 BLMHQ13867 455 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 BRICD5Q6PL45 260 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 ASRGL1Q7L266 308 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 FAM185AQ8N0U4 392 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 NRIP2Q9BQI9 281 aa22.24■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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LMO1-202ENST00000428101 HTR1FP30939 366 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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LMO1-202ENST00000428101 YIPF7Q8N8F6 280 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 OR5D13Q8NGL4 314 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 C17orf50Q8WW18 174 aa22.23■■□□□ 1.15
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LMO1-202ENST00000428101 GABARAPL3Q9BY60 117 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 HES4Q9HCC6 221 aa22.23■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa22.23■■□□□ 1.15
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LMO1-202ENST00000428101 OR2T7P0C7T2 308 aa22.22■■□□□ 1.15
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LMO1-202ENST00000428101 BATF2Q8N1L9 274 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 C11orf42Q8N5U0 333 aa22.22■■□□□ 1.15
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LMO1-202ENST00000428101 C16orf95Q9H693 158 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 OAZ3Q9UMX2 235 aa22.22■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 VWFP04275 2813 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 NXPH2O95156 264 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 KRT8P05787 483 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 ODF4Q2M2E3 257 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 TMEM200BQ69YZ2 307 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 ANGPTL5Q86XS5 388 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 MKXQ8IYA7 352 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 RORBQ92753 470 aa22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LMO1-202ENST00000428101 SLC1A7O00341 560 aa22.2■■□□□ 1.14
LMO1-202ENST00000428101 ERVK11-1P61568 191 aa22.2■■□□□ 1.14
LMO1-202ENST00000428101 RPL31P62899 125 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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