RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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POLR1A-204ENST00000424089 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.028e-7■■■■□ 23.2
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POLR1A-204ENST00000424089 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 BEX1Q9HBH7 125 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.68□□□□□ -1.02
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