RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411292.1

SNORD71-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 71, humanhuman

BASIC

Gene SNORD71, Length 86 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD71-201ENST00000411292 PPIL1Q9Y3C6 166 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 HES2Q9Y543 173 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 FADS3Q9Y5Q0 445 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 MTCH2Q9Y6C9 303 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 MED13Q9UHV7 2174 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 ITGB4P16144 1822 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 LTBP2Q14767 1821 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 FBN2P35556 2912 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 TRPM6Q9BX84 2022 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 FREM1Q5H8C1 2179 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 COL6A3P12111 3177 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 MPDZO75970 2070 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 RYR3Q15413 4870 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD71-201ENST00000411292 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 A0A0J9YYE9 177 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SMCO3A2RU48 225 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 MYBPHLA2RUH7 354 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GMNCA6NCL1 334 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SMCO2A6NFE2 343 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SDHAF1A6NFY7 115 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 C17orf98A8MV24 154 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 A8MWL6 223 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 A8MWP4 228 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ODF3BA8MYP8 253 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GGTLC3B5MD39 225 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 H3BMM0 161 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GOLGA8TH3BQL2 631 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 H7C0C1 242 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 J3QLI3 93 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 J3QT63 122 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 DFFAO00273 331 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ISLRO14498 428 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 CDIPTO14735 213 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 AIM2O14862 343 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SLC31A1O15431 190 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GYG2O15488 501 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 AKR7A2O43488 359 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 XRCC2O43543 280 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SLC37A4O43826 429 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 MPDU1O75352 247 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 RDH16O75452 317 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 CNMDO75829 334 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 TRAPPC6AO75865 159 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 S1PR2O95136 353 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PLEKHA8P1O95397 391 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 BRI3O95415 125 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 CDS2O95674 445 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 IGLV6-57P01721 117 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 TRBC1P01850 177 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 IGHMP01871 453 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 OPN1SWP03999 348 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 MAS1P04201 325 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 OR5AL1P0C617 328 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 OR4Q2P0C623 313 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GZMAP12544 262 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF24P17028 368 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PTMSP20962 102 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GSTM3P21266 225 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PRKACBP22694 351 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 MYL9P24844 172 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SLC6A1P30531 599 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 MPIP34949 423 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 APLNRP35414 380 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 PCK1P35558 622 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GGT2P36268 569 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 COILP38432 576 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 MAGEA1P43355 309 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GALR1P47211 349 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 LGALS7P47929 136 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ATP5OP48047 213 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ACOT2P49753 483 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 RGS6P49758 472 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ATP5J2P56134 94 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 C21orf59P57076 290 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 TAS2R46P59540 309 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 GRB2P62993 217 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 SLC35A1P78382 337 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 LCN2P80188 198 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ATP5G2Q06055 141 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 BAXQ07812 192 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 TRDNQ13061 729 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD71-201ENST00000411292 ART3Q13508 389 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms