RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM225BP0DP42 221 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GTF2F2P13984 249 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 BMP5P22003 454 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GNLYP22749 145 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GDNFP39905 211 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PMELP40967 661 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CBX5P45973 191 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RFX2P48378 723 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GNG3P63215 75 aa8.41□□□□□ -1.06
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POLR1A-202ENST00000409024 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.41□□□□□ -1.06
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POLR1A-202ENST00000409024 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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POLR1A-202ENST00000409024 MTFR2Q6P444 385 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR52I2Q8NH67 350 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ENKURQ8TC29 256 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GPX8Q8TED1 209 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 S100PBPQ96BU1 408 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CMBLQ96DG6 245 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MICU1Q9BPX6 476 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PKIBQ9C010 78 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 NGBQ9NPG2 151 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CACNG2Q9Y698 323 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SPG11Q96JI7 2443 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FBN3Q75N90 2809 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GWJ7 208 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM210A6NLX4 147 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SERPINE3A8MV23 424 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MPIG6BO95866 241 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CELA3BP08861 270 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CD3GP09693 182 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 MGMTP16455 207 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TBPP20226 339 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PTAFRP25105 342 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SLC6A1P30531 599 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GCH1P30793 250 aa8.4□□□□□ -1.06
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POLR1A-202ENST00000409024 GLRXP35754 106 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 ASCL1P50553 236 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RAG2P55895 527 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PLA2G7Q13093 441 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RSU1Q15404 277 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TSC22D1Q15714 1073 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 TAB1Q15750 504 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 FAM76BQ5HYJ3 339 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PLET1Q6UQ28 207 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00596Q86U02 117 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RAB3CQ96E17 227 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 SPACA5Q96QH8 159 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 GAL3ST1Q99999 423 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PLK3Q9H4B4 646 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 HSF4Q9ULV5 492 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 PDZD2O15018 2839 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 APCP25054 2843 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GUH1 482 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GVG6 124 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PR80 420 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 LANCL1O43813 399 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 FAM157BP0CG42 384 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 RNF224P0DH78 156 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 MPZP25189 248 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 RCVRNP35243 200 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 VEGFCP49767 419 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 BTG1P62324 171 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-202ENST00000409024 FAM27E3Q08E93 113 aa8.39□□□□□ -1.07
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