RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371953.7

PTEN-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTEN, Length 9,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-201ENST00000371953 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 GPR37O15354 613 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 SLCO2B1O94956 709 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 HTR1DP28221 377 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 LIPHQ8WWY8 451 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 GPA33Q99795 319 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 CTAG2O75638 210 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 NMBP08949 121 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 DUSP8Q13202 625 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 IGHA1P01876 353 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 SCD5Q86SK9 330 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ABHD1Q96SE0 405 aa14.94□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 GABRA6Q16445 453 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 MS4A8Q9BY19 250 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 CRHP06850 196 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PPT2Q9UMR5 302 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ZNF732B4DXR9 585 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 CST7O76096 145 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 IL10RAQ13651 578 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 KHDC3LQ587J8 217 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 KCND3Q9UK17 655 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 RAB33BQ9H082 229 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 P2RY12Q9H244 342 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 EDN3P14138 238 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 C7orf66A4D0T2 115 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ZNF253O75346 499 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 CBR3O75828 277 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PI3P19957 117 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 CLDN17P56750 224 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 DEFB103AP81534 67 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.93□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 FAM87AP0C7U9 286 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 C12orf73Q69YU5 71 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ASB16Q96NS5 453 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PARP14Q460N5 1801 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 RAB29O14966 203 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 SOCS7O14512 581 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 OR2C3Q8N628 320 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 OR1P1Q8NH06 330 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 MRGPRGQ86SM5 289 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 EDN1P05305 212 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 P2RY1P47900 373 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 MMP16P51512 607 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 C1SP09871 688 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 DAOP14920 347 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 TAAR6Q96RI8 345 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 C11orf94C9JXX5 98 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 OR2A5Q96R48 311 aa14.92□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 SFT2D2O95562 160 aa14.91□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 OPN1LWP04000 364 aa14.91□□□□□ -0.02
PTEN-201ENST00000371953 ST6GAL1P15907 406 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms