RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HSP90B2PQ58FF3 399 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ANXA8L1Q5VT79 327 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RESP18Q5W5W9 173 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LRRC66Q68CR7 880 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM53Q6P2H8 277 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UQCC3Q6UW78 93 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FBXW12Q6X9E4 464 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC35D2Q76EJ3 337 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FA2HQ7L5A8 372 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NIPA1Q7RTP0 329 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC00523Q86TU6 105 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ITPRIPQ8IWB1 547 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AMN1Q8IY45 258 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KIF2BQ8N4N8 673 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DRAM1Q8N682 238 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCNYL1Q8N7R7 359 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZDHHC22Q8N966 263 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LRRC75AQ8NAA5 344 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SDR9C7Q8NEX9 313 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PROKR2Q8NFJ6 384 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR8G5Q8NG78 346 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR6N2Q8NGY6 317 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR4A5Q8NH83 315 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CLHC1Q8NHS4 586 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UBA3Q8TBC4 463 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPPL2BQ8TCT7 592 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RNF133Q8WVZ7 376 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GHSRQ92847 366 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HIST1H2BAQ96A08 127 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPEQ96AT9 228 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CLDN23Q96B33 292 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC127Q96BQ5 260 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CERS2Q96G23 380 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SMIM8Q96KF7 97 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MTMR9Q96QG7 549 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR4K3Q96R72 315 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 VAT1Q99536 393 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PITX2Q99697 317 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GGTLC1Q9BX51 225 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HINT2Q9BX68 163 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DEFB129Q9H1M3 183 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BLZF1Q9H2G9 400 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RGCCQ9H4X1 137 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 REEP1Q9H902 201 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RDH14Q9HBH5 336 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C8orf17Q9NRJ1 99 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COMMD9Q9P000 198 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PSG8Q9UQ74 426 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ASB3Q9Y575 518 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ORC6Q9Y5N6 252 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR51B4Q9Y5P0 310 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PCM1Q15154 2024 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UBN2Q6ZU65 1347 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NRCAMQ92823 1304 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SMIM26A0A096LP01 95 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1W2PPE3 182 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1W2PPV9 198 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C16orf90A8MZG2 172 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGLL5B9A064 214 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 F5H5P2 479 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 F5H5T6 163 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 G3V3Q6 166 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H0YIV9 168 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H3BN98 237 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LY6LH3BQJ8 138 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 K7EPK0 472 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PSMD11O00231 422 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BCKDKO14874 412 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FABP7O15540 132 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CRXO43186 299 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms