RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TGM4P49221 684 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GPM6AP51674 278 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R43P59537 309 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GMFBP60983 142 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 BAMBIQ13145 260 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 WDR38Q5JTN6 314 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CEP78Q5JTW2 689 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 STUMQ69YW2 141 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FDX2Q6P4F2 183 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.35□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.35□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 OR52N1Q8NH53 320 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 APH1BQ8WW43 257 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 THRSPQ92748 146 aa6.35□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 RNF170Q96K19 258 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DUX5Q96PT3 197 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CCL13Q99616 98 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 GPR84Q9NQS5 396 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.35□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.35□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.35□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 J3QLW9 94 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MYL12BO14950 172 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 AKR7A2O43488 359 aa6.34□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 TOX4O94842 621 aa6.34□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF19P17023 458 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CCL1P22362 96 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PRTN3P24158 256 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CFPP27918 469 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GNG3P63215 75 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF85Q03923 595 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 ST3GAL4Q11206 333 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 IKZF1Q13422 519 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 GPR157Q5UAW9 335 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 RNLSQ5VYX0 342 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.34□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 FGFRL1Q8N441 504 aa6.34□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 PP6455Q8WZ26 134 aa6.34□□□□□ -1.39
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SGMS1-201ENST00000361543 SEH1LQ96EE3 360 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf36Q96KX1 117 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 WDFY2Q96P53 400 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 TBX15Q96SF7 602 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MND1Q9BWT6 205 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.34□□□□□ -1.39
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