RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF222Q9UK12 451 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 COL6A5A8TX70 2615 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 OR2AT4A6NND4 320 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RNF212BA8MTL3 300 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TCF21O43680 179 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PSG2P11465 335 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MPZP25189 248 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 DCKP27707 260 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TGM4P49221 684 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FGF12P61328 243 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 DGUOKQ16854 277 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 OR2G6Q5TZ20 316 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ACP7Q6ZNF0 438 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 BTN2A1Q7KYR7 527 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PHC2Q8IXK0 858 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF676Q8N7Q3 588 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GGHQ92820 318 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TMIGD2Q96BF3 282 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FGGYQ96C11 551 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 C10orf35Q96D05 121 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SLC6A7Q99884 636 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC2DQ9UHP7 191 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 HHLA2Q9UM44 414 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SLC7A11Q9UPY5 501 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV40A0A0B4J280 105 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NKX6-3A6NJ46 265 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SIGLEC5O15389 551 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 XPNPEP2O43895 674 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZFPL1O95159 310 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 VENTXO95231 258 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PLATP00750 562 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MMP9P14780 707 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF20P17024 532 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GABRA2P47869 451 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 AQP4P55087 323 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CD276Q5ZPR3 534 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 OR13C3Q8NGS6 347 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PP6455Q8WZ26 134 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TFAP2CQ92754 450 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 UPRTQ96BW1 309 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 BORCS8Q96FH0 119 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NRIP2Q9BQI9 281 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PKIBQ9C010 78 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 DNTTIP1Q9H147 329 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 VCXQ9H320 206 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF69Q9UC07 566 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MAB21L2Q9Y586 359 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM212A6NML5 194 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFB3O43676 98 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 LALBAP00709 142 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SFTPBP07988 381 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 PPIAL4GP0DN37 164 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ATF1P18846 271 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 FUT6P51993 359 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ERVK11-1P61568 191 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IL13RA1P78552 427 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 UTS2BQ765I0 119 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RNF144BQ7Z419 303 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 EGFL6Q8IUX8 553 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM80Q96HE8 168 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 TBX15Q96SF7 602 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 HES4Q9HCC6 221 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 NUP50Q9UKX7 468 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CSAG1-201ENST00000361211 IRGMA1A4Y4 181 aa12.33□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 RFPL4AA6NLU0 287 aa12.33□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF879B4DU55 563 aa12.33□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa12.33□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 F8VVB4 439 aa12.33□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 F8VWA3 439 aa12.33□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 INMTO95050 263 aa12.33□□□□□ -0.44
CSAG1-201ENST00000361211 NXPH2O95156 264 aa12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms