RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ERGIC1Q969X5 290 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 RND1Q92730 232 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFB6O95139 128 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 GZMKP49863 264 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB5CP51148 216 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ETFDHQ16134 617 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 HRASP01112 189 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CD3EP07766 207 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF17P17021 662 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 MOB3BQ86TA1 216 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf35Q96D05 121 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CTAG2O75638 210 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2G2P60604 165 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2M7Q8NG81 312 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF721Q8TF20 911 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SOX7Q9BT81 388 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 EPOPA6NHQ4 379 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 LY86O95711 162 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 MPGP29372 298 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 STPG1Q5TH74 334 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 LCN15Q6UWW0 184 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6S1Q8NH40 331 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 NME2P1O60361 137 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL17Q92583 94 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 HGDQ93099 445 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 TPPP3Q9BW30 176 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 OCEL1Q9H607 264 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 hADV38S2A0JD32 116 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 OR13C7P0DN81 318 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM11P17152 192 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB7AP51149 207 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 TXN2Q99757 166 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 FOCADQ5VW36 1801 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 AARDQ4LEZ3 155 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 FZR1Q9UM11 496 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 OGG1O15527 345 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC14BO60729 498 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 NGFRP08138 427 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL2P13500 99 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SELENOPP49908 381 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 INSL4Q14641 139 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 OR7C2O60412 319 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB1CQ92928 201 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 PTP4A1Q93096 173 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 GNG13Q9P2W3 67 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 BGLAPP02818 100 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 SP1P08047 785 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 RAG2P55895 527 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 PDCD1Q15116 288 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-201ENST00000344528 C20orf202A1L168 122 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 KRASP01116 189 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 CEACAM6P40199 344 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR3A4PP47883 348 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM230Q96A57 120 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MTCH1Q9NZJ7 389 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHA1P01876 353 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 TIGITQ495A1 244 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 STUMQ69YW2 141 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms