RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLIC3O95833 236 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR1AP08908 422 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGA5P0DJD9 388 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF19P17023 458 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPZP25189 248 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL13RA1P78552 427 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALEQ14376 348 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2V2Q15819 145 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF691Q5VV52 312 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALHM1Q8IU99 346 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYS1Q8N2H4 156 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC22Q8N966 263 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPRL2Q8WTW4 380 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 JMJD8Q96S16 334 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf4Q9NR00 106 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 INPP5EQ9NRR6 644 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 GATBO75879 557 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISG15P05161 165 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSG2P11465 335 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR9P51686 369 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC10Q5BKY1 277 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACP7Q6ZNF0 438 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY6G5BQ8NDX9 201 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10AC1Q8NH08 325 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNIH3Q8TBE1 160 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYGBQ8WWM9 190 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf35Q96D05 121 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDFY2Q96P53 400 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASL12Q9NYN1 266 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR37O15354 613 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOX4O94842 621 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM21Q3B7S5 101 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED30Q96HR3 178 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCTN5Q9BTE1 182 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 JAM3Q9BX67 310 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKIBQ9C010 78 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 HES4Q9HCC6 221 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A11Q9UPY5 501 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAB21L2Q9Y586 359 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM77I1YAP6 450 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRA2P47869 451 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARF6P62330 175 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL24Q13007 206 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL22Q53GT1 634 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRD3OSQ6XYD6 125 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 BATF2Q8N1L9 274 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf46Q8TAG6 207 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PP6455Q8WZ26 134 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDSLQ96GA7 329 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 E9PI62 339 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIMS3P0CW19 117 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIMS4P0CW20 117 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUT6P51993 359 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAV3P56539 151 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK11-1P61568 191 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBA52P62987 128 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR157Q5UAW9 335 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC23Q5W5X9 447 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD177Q8N6Q3 437 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNRF1Q8ND25 227 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM216AQ8WUB2 273 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 HHLA2Q9UM44 414 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms