RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 UMAD1C9J7I0 102 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 DANCRP0C864 163 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 RD3LP0DJH9 198 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 OR13C7P0DN81 318 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 SFTPDP35247 375 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 NCMAPQ5T1S8 102 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 LYZL2Q7Z4W2 148 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 CD300LFQ8TDQ1 290 aa22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PRF1P14222 555 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 GLP1RP43220 463 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 TINAGQ9UJW2 476 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 TMEM225BP0DP42 221 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 CAMLGP49069 296 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 SULT1A1P50225 295 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 BRICD5Q6PL45 260 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 C20orf196Q8IYI0 205 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PADI1Q9ULC6 663 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.12■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 OR5H15A6NDH6 313 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PIGPP57054 158 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 NHLH2Q02577 135 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PLPPR5Q32ZL2 321 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 TAAR9Q96RI9 348 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 FAAP24Q9BTP7 215 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 ARV1Q9H2C2 271 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 OR5AC1P0C628 307 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PLXDC2Q6UX71 529 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 OR52M1Q8NGK5 317 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa22.11■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 ANGPTL7O43827 346 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 IFNA21P01568 189 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 ZNF43P17038 809 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 AKR7LQ8NHP1 331 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 HPSE2Q8WWQ2 592 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 C19orf12Q9NSK7 152 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 A0A1B0GX78 115 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 DBHP09172 617 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 RARRES2Q99969 163 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 EXPH5Q8NEV8 1989 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 SERPINE3A8MV23 424 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 OR5H8P0DN80 308 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 UCP2P55851 309 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PHLDA2Q53GA4 152 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 OR51M1Q9H341 326 aa22.1■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 FAM221AA4D161 298 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PRH1P02810 166 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 FXYD4P59646 89 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 HMGN3Q15651 99 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 OR10G3Q8NGC4 313 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 CHRDQ9H2X0 955 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PIGLQ9Y2B2 252 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 TM2D1Q9BX74 207 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PISDQ9UG56 409 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 IGLV3-19P01714 112 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 PTGDSP41222 190 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 SHHQ15465 462 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 LRRC18Q8N456 261 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 NAXEQ8NCW5 288 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 TUBA4BQ9H853 241 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 ANXA10Q9UJ72 324 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-201ENST00000321337 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa22.08■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.08■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 PPIHO43447 177 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 CHAF1BQ13112 559 aa22.08■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 TMEM187Q14656 261 aa22.08■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 TAF9Q16594 264 aa22.08■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa22.08■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 IGHV2-70P01814 119 aa22.07■■□□□ 1.12
SENP3-201ENST00000321337 FAM69BQ5VUD6 431 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms