RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 PP6455Q8WZ26 134 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 CLDN23Q96B33 292 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 HPF1Q9NWY4 346 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 LCATP04180 440 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXB3-201ENST00000311626 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 TM2D1Q9BX74 207 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 AK3Q9UIJ7 227 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 SERPINE3A8MV23 424 aa22.08■■□□□ 1.13
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HOXB3-201ENST00000311626 IL15RAQ13261 267 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 UQCC3Q6UW78 93 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 SLC16A14Q7RTX9 510 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 SULF2Q8IWU5 870 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 SPTSSAQ969W0 71 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 REEP6Q96HR9 211 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 AQP10Q96PS8 301 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-201ENST00000311626 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.08■■□□□ 1.12
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HOXB3-201ENST00000311626 HKR1P10072 659 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 ALDH3B1P43353 468 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 RSU1Q15404 277 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 PIGYQ3MUY2 71 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 PLXDC2Q6UX71 529 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 FGFBP3Q8TAT2 258 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 Q96M66 194 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 SGCEO43556 437 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 FGF5P12034 268 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 LPAR6P43657 344 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 NPBWR1P48145 328 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF84P51523 738 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 HIST1H3AP68431 136 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 NAAAQ02083 359 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 HIST2H3AQ71DI3 136 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 GHRLQ9UBU3 117 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 A0A087WZY1 265 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 SCRN3Q0VDG4 424 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 FAM189A2Q15884 450 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 SULT4A1Q9BR01 284 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF850A8MQ14 1090 aa22.06■■□□□ 1.12
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HOXB3-201ENST00000311626 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 IGHV3-9P01782 118 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 RFPL3SP0C7P2 107 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 TAF9BQ9HBM6 251 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 MED6O75586 246 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 NFYBP25208 207 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 GGNBP1Q5YKI7 109 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 C5orf24Q7Z6I8 188 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 SVBPQ8N300 66 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 ANXA10Q9UJ72 324 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF32P17041 273 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 PHLDA2Q53GA4 152 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 HLA-CQ95604 372 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 WDR54Q9H977 334 aa22.05■■□□□ 1.12
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HOXB3-201ENST00000311626 PADI1Q9ULC6 663 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 NR2C1P13056 603 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 SGPP2Q8IWX5 399 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 OR14L1PQ8NHC6 308 aa22.04■■□□□ 1.12
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HOXB3-201ENST00000311626 METTL9Q9H1A3 318 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 MMP26Q9NRE1 261 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 NCKAP5O14513 1909 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 CXCL13O43927 109 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 IGKV1D-12P01611 117 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 AKIRIN2Q53H80 203 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 CCDC157Q569K6 752 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-201ENST00000311626 FAM27BQ5VT28 67 aa22.04■■□□□ 1.12
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