RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299575.4

ATMIN-201, Transcript of ATM interactor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATMIN, Length 4,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMIN-201ENST00000299575 LAMP3Q9UQV4 416 aa20.05■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 C4orf51C9J302 202 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 THNSL2Q86YJ6 484 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 OR8U1Q8NH10 309 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 BTF3L4Q96K17 158 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CA6P23280 308 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 HES1Q14469 280 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 GNG13Q9P2W3 67 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 A0A1W2PR80 420 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ASB5Q8WWX0 329 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 GPR87Q9BY21 358 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ATPIF1Q9UII2 106 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ASXL3Q9C0F0 2248 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 F6UZH7 168 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 FOXL2P58012 376 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ZPLD1Q8TCW7 415 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 FBLIM1Q8WUP2 373 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 PRRX2Q99811 253 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 PSENENQ9NZ42 101 aa20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CBR1P16152 277 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 LHX4Q969G2 390 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 TIMD4Q96H15 378 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 RAB18Q9NP72 206 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 SFT2D2O95562 160 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 SELENOPP49908 381 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 MPPED2Q15777 294 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 FAM58AQ8N1B3 248 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 OR2M3Q8NG83 312 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 WDR54Q9H977 334 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 C9orf170A2RU37 121 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 UMAD1C9J7I0 102 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CT45A6P0DMU7 189 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CT45A5P0DMU8 189 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CT45A7P0DMV0 189 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 S100A7P31151 101 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 PRSS12P56730 875 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CT45A1Q5HYN5 189 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 OR5AP2Q8NGF4 316 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CT45A3Q8NHU0 189 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 AP1S3Q96PC3 154 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 H3BP45 60 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 DSPPQ9NZW4 1301 aa20.03■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 MMP16P51512 607 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 MRGPREQ86SM8 312 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CCL2P13500 99 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 TMEM123Q8N131 208 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 SLC26A10Q8NG04 563 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 UBALD1Q8TB05 177 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 P2RX3P56373 397 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 IFITM3Q01628 133 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 AANATQ16613 207 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 NHLRC1Q6VVB1 395 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.02■□□□□ 0.8
ATMIN-201ENST00000299575 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa20.02■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 MED9Q9NWA0 146 aa20.02■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 CNIH1O95406 144 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 OR10X1Q8NGY0 326 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 CLDN23Q96B33 292 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 DCTN6O00399 190 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 DEFA4P12838 97 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 ABCD4O14678 606 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 CST7O76096 145 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 TMED3Q9Y3Q3 217 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 SMIM10L1P0DMW3 83 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 LIMK1P53667 647 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 RTL8BQ17RB0 113 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 PXDC1Q5TGL8 231 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 SMIM10Q96HG1 83 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 SLC35E1Q96K37 410 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 UCN2Q96RP3 112 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 NDRG3Q9UGV2 375 aa20.01■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 NGFRP08138 427 aa20■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 PNLIPP16233 465 aa20■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 NGFP01138 241 aa20■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 GGTLC2Q14390 218 aa20■□□□□ 0.79
ATMIN-201ENST00000299575 ALKBH6Q3KRA9 238 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms