RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 LY6EQ16553 131 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 KCNMB1Q16558 191 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 MICBQ29980 383 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 OTPQ5XKR4 325 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 Q96M85 177 aa9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 J3QRK9 145 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 NDUFB3O43676 98 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 LCATP04180 440 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 GRPP07492 148 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 CD28P10747 220 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 EPHA2P29317 976 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 VBP1P61758 197 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 HIST1H3AP68431 136 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 ECH1Q13011 328 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 AANATQ16613 207 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 MESTQ5EB52 335 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 NRMQ8IXM6 262 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 CCL13Q99616 98 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 MND1Q9BWT6 205 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 SYT4Q9H2B2 425 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.77□□□□□ -0.84
SPC25-201ENST00000282074 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 CD300LBA8K4G0 201 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 F5H5K5 113 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 MAGEB3O15480 346 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 DIRAS1O95057 198 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 LHBP01229 141 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 ACSM4P0C7M7 580 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 GALP22466 123 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 GRK5P34947 590 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 OR1E2P47887 323 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 CENPAP49450 140 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 NCS1P62166 190 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 KLRD1Q13241 179 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 FHL1Q13642 323 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 SEC23BQ15437 767 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 KLHL22Q53GT1 634 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 SPANXN2Q5MJ10 180 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 ZNF826PQ6ZT77 177 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 Q8N7P7 452 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 TNFRSF14Q92956 283 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 TMEM80Q96HE8 168 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 MGLLQ99685 303 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 GGT3PA6NGU5 568 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 PEX14O75381 377 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 PPP1R3DO95685 299 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 APOA1P02647 267 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 TPTEP56180 551 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 CBX3Q13185 183 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 WDR38Q5JTN6 314 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 CORO6Q6QEF8 472 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 FAM122BQ7Z309 247 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 CCDC190Q86UF4 302 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 FGFRL1Q8N441 504 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 PNKDQ8N490 385 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.75□□□□□ -0.85
SPC25-201ENST00000282074 PRRC1Q96M27 445 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms