RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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CSDE1-201ENST00000261443 COL10A1Q03692 680 aa6.36□□□□□ -1.39
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CSDE1-201ENST00000261443 ECI1P42126 302 aa6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 ZNF266Q14584 549 aa6.35□□□□□ -1.39
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CSDE1-201ENST00000261443 A0A1B0GU03 582 aa6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 HIDE1A8MVS5 230 aa6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 M0QZK8 103 aa6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 SCDO00767 359 aa6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 RAB11AP62491 216 aa6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 PMS2P11Q13670 270 aa6.35□□□□□ -1.39
CSDE1-201ENST00000261443 GNMTQ14749 295 aa6.35□□□□□ -1.39
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