RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 AVPP01185 164 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CAV3P56539 151 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 GALK2Q01415 458 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF774Q6NX45 483 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FGFBP3Q8TAT2 258 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP19Q96LK0 163 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC30A2Q9BRI3 323 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RGCCQ9H4X1 137 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 NARFLQ9H6Q4 476 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 LPAR2Q9HBW0 351 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 IFITM5A6NNB3 132 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 F5H5K5 113 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 AIPO00170 330 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RY10O00398 339 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RP2O75695 350 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MSMBP08118 114 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH3B1P43353 468 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEB1P43366 347 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RANBP1P43487 201 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA12Q8IW75 414 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 OR13C3Q8NGS6 347 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PGAM5Q96HS1 289 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10A2Q9H208 303 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB9Q9NP78 766 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TREM2Q9NZC2 230 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 DHRS7CA6NNS2 312 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R233 179 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS5O15539 181 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10A3P58181 314 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ODF4Q2M2E3 257 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 IDNKQ5T6J7 187 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 COLCA1Q6ZS62 124 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM57BQ71RH2 274 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM216AQ8WUB2 273 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT3Q9BQG1 590 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MIXL1Q9H2W2 232 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF121Q9H920 327 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 BRD7Q9NPI1 651 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF319Q9P2F9 582 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ALX3O95076 343 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 GLRXP35754 106 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR5AP47898 357 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 HILS1P60008 231 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF529Q6P280 563 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH26Q8IXH8 852 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5D14Q8NGL3 314 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RDH5Q92781 318 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 GFI1Q99684 422 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CALCBP10092 127 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ADRA2CP18825 462 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 DDOSTP39656 456 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB1AP62820 205 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PLP2Q04941 152 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PGAP1Q75T13 922 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 AKR7LQ8NHP1 331 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SOSTQ9BQB4 213 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A5Q9H3V2 200 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR84Q9NQS5 396 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA2Q9UM82 520 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CMYA5Q8N3K9 4069 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PATE4P0C8F1 98 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ATF1P18846 271 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTG1P63261 375 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 GSG1Q2KHT4 349 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 ASPHD2Q6ICH7 369 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 NKAIN3Q8N8D7 197 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 COMMD3Q9UBI1 195 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 FZR1Q9UM11 496 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 V9GYS6 101 aa20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM30A4D0T7 59 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 DBHP09172 617 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CD79AP11912 226 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A9P48067 706 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPZA1P52907 286 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM33P57088 247 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA40Q86UY6 237 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF584Q8IVC4 421 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 LAX1Q8IWV1 398 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-216ENST00000628306 SGK3Q96BR1 496 aa20.39■□□□□ 0.85
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