RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1B0GUS0 222 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 TIMM23O14925 209 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDAP32320 146 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 OPRL1P41146 370 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 MMP16P51512 607 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF627Q7L945 461 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRI1Q9BV20 369 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 RGS5O15539 181 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXH1O75593 365 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZFPL1O95159 310 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 UCHL1P09936 223 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB3BP20337 219 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF45Q02386 682 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF154Q13106 437 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 DOC2BQ14184 412 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 HFEQ30201 348 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 DDI2Q5TDH0 399 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 PALMDQ9NP74 551 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPR160Q9UJ42 338 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 HHLA2Q9UM44 414 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 DHDHQ9UQ10 334 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ISPDA4D126 451 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR4C45A6NMZ5 311 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SC5DO75845 299 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 TGFBR1P36897 503 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAG2P55895 527 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 KRTAP10-3P60369 221 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPP3R1P63098 170 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC36A2Q495M3 483 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 CORO6Q6QEF8 472 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRRC18Q8N456 261 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF283Q8N7M2 679 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR4F5Q8NH21 305 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 AMELYQ99218 206 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 KCNJ15Q99712 375 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 ATF6BQ99941 703 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 DECR2Q9NUI1 292 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.77□□□□□ -0.04
TRAPPC3-209ENST00000616395 A0A1B0GVI7 797 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TSPAN15O95858 294 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ISG15P05161 165 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM157BP0CG42 384 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SELENOVP59797 346 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB1AP62820 205 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 WDR38Q5JTN6 314 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 Q6ZPA2 131 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCL17Q92583 94 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAP6Q96JE9 813 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR14A2Q96R54 314 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF121Q9H920 327 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.76□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SGCEO43556 437 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBL3O95164 117 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SRMP19623 302 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TPTEP56180 551 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 OTPQ5XKR4 325 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NABP1Q96AH0 204 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 NOTOA8MTQ0 251 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRR32B1ATL7 298 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 PIN1P1O15428 100 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-209ENST00000616395 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms