RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CCSO14618 274 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HMGA2P52926 109 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SYT8Q8NBV8 401 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CSF3RQ99062 836 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 BANF2Q9H503 90 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 Q9N2K0 584 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FZD9O00144 591 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LRP3O75074 770 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R17O96001 155 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A4P12235 298 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CCR2P41597 374 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SULT1A1P50225 295 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CST9Q5W186 159 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM25Q86YD3 366 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB119Q8N690 84 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAM210BQ96KR6 192 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 KCNAB3O43448 404 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SELENBP1Q13228 472 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TAPBPO15533 448 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MT-ND6P03923 174 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NMUP48645 174 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DOK1Q99704 481 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 S1PR2O95136 353 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DSC1Q08554 894 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GPR87Q9BY21 358 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NHSQ6T4R5 1651 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MBTPS2O43462 519 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZSR9 355 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MED25Q71SY5 747 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 F5H697 171 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TEX37Q96LM6 180 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NEURL2Q9BR09 285 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CALHM2Q9HA72 323 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TBXA2RP21731 343 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PLP1P60201 277 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RUNX3Q13761 415 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 AAED1Q7RTV5 226 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RHBDL1O75783 438 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PRSS1P07477 247 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 IGSF11Q5DX21 431 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SCD5Q86SK9 330 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 STPG2Q8N412 459 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MOB3AQ96BX8 217 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 P2RY12Q9H244 342 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MFNGO00587 321 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NXPH3O95157 252 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GYPAP02724 150 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NAT2P11245 290 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LBX1P52954 281 aa6.31□□□□□ -1.4
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