RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINA5	P05154	406 aa		16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	OR10C1	Q96KK4	312 aa		16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HPF1	Q9NWY4	346 aa		16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		16.11	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TSPAN9	O75954	239 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	IL15RA	Q13261	267 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RAB35	Q15286	201 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TMED6	Q8WW62	240 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PIGT	Q969N2	578 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559		Q96M66	194 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	IER2	Q9BTL4	223 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ABCD4	O14678	606 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MTCP1	P56278	107 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RAB32	Q13637	225 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PMS2CL	Q68D20	193 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SULF2	Q8IWU5	870 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SGK3	Q96BR1	496 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO17	Q96EF6	278 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	METTL9	Q9H1A3	318 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MMP26	Q9NRE1	261 aa		16.1	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SGCE	O43556	437 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM225B	P0DP42	221 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HOXA6	P31267	233 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SGCZ	Q96LD1	299 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HSF4	Q9ULV5	492 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RTTN	Q86VV8	2226 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0J9YW62	118 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MSGN1	A6NI15	193 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF11	O14788	317 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	KNG1	P01042	644 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	DBH	P09172	617 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CRYGS	P22914	178 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GABRR1	P24046	479 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MLF1	P58340	268 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RAC3	P60763	192 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PRR13	Q9NZ81	148 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		16.09	■□□□□ 0.17
RRN3-205	ENST00000563559	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	HOXB5	P09067	269 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CST2	P09228	141 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FAM157C	P0CG43	387 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	RSU1	Q15404	277 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	DECR2	Q9NUI1	292 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	16.08	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PLAT	P00750	562 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	S100A10	P60903	97 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IFNA21	P01568	189 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	DTYMK	P23919	212 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PTGER4	P35408	488 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	REEP6	Q96HR9	211 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CYYR1	Q96J86	154 aa		16.07	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	GPR173	Q9NS66	373 aa		16.07	■□□□□ 0.16

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