RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 GFRA1P56159 465 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 RAB31Q13636 194 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ASB11Q8WXH4 323 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 TMED7Q9Y3B3 224 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 YIPF1Q9Y548 306 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A0U1RQK1 487 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1B0GW15 77 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 RAMP2O60895 175 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CT45A8P0DMV1 189 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CT45A9P0DMV2 189 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 MMP9P14780 707 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC6A8P48029 635 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 EXT1Q16394 746 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 PGGHGQ32M88 737 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 Q8N976 141 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 WBP2Q969T9 261 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 RNF39Q9H2S5 420 aa9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CDC14CA4D256 554 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 OR4Q2P0C623 313 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 GABRA3P34903 492 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 RAB32Q13637 225 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ICAM4Q14773 271 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM205Q6UW68 189 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CMC2Q9NRP2 79 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 GJB5O95377 273 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC35E2P0CK97 266 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 TSPOP30536 169 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 TAS2R41P59536 307 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF92Q03936 586 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SPATA45Q537H7 98 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 IGSF8Q969P0 613 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 PSMG2Q969U7 264 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 PLK3Q9H4B4 646 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 MED20Q9H944 212 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2T8A6NH00 312 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 GPR182O15218 404 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 OR10J4P0C629 311 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 GRK6P43250 576 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 EFNB2P52799 333 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ARG2P78540 354 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 LTBQ06643 244 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CDK5R1Q15078 307 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 NUDT9Q9BW91 350 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 GPR27Q9NS67 375 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 OBP2AQ9NY56 170 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 GULP1Q9UBP9 304 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 NUMA1Q14980 2115 aa9.74□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ID1P41134 155 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 SMIM11AP58511 58 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 BAXQ07812 192 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 IL15RAQ13261 267 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 RFLNBQ8N5W9 214 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 RCBTB1Q8NDN9 531 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CNIH4Q9P003 139 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 LILRA1O75019 489 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 GNMTQ14749 295 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ELOCQ15369 112 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 HLA-BQ31612 363 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF385BQ569K4 471 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 CPTPQ5TA50 214 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 OPN5Q6U736 354 aa9.73□□□□□ -0.85
SEMA4B-204ENST00000558065 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms