RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 ZNF222Q9UK12 451 aa3.33□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 NACAE9PAV3 2078 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 A0A1B0GTI1 187 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 TMEM223A0PJW6 202 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 CCDC22O60826 627 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 IGKV1D-16P01601 117 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 IGHV3-11P01762 117 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 DRD3P35462 400 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
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USP15-218ENST00000552346 KIR3DL2P43630 455 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 TAS2R31P59538 309 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 IL5RAQ01344 420 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 CCL15Q16663 113 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 ZNF691Q5VV52 312 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 GUSBP11Q6P575 273 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 Q6ZT83 130 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 WDR86Q86TI4 376 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 GAPTQ8N292 157 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 LRRC52Q8N7C0 313 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 OR1L1Q8NH94 360 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 GHSRQ92847 366 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 RILPQ96NA2 401 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 TMED9Q9BVK6 235 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 BEX2Q9BXY8 128 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 OR5H1A6NKK0 313 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 MKRN2OSH3BPM6 223 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 CLDN34H7C241 214 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 M0R1X1 148 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 NDUFS5O43920 106 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 CDK14O94921 469 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 IGLV2-8P01709 118 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 PSMB5P28074 263 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 CRATP43155 626 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 MAGEA6P43360 314 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 UBE2KP61086 200 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 Q6ZSR6 202 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 AHSA2Q719I0 299 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 LRRC6Q86X45 466 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 SFXN5Q8TD22 340 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 RORBQ92753 470 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 MED10Q9BTT4 135 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 TNS2Q63HR2 1409 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 C5orf63A6NC05 138 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 TCAPO15273 167 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 OR56A5P0C7T3 313 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 RAB38P57729 211 aa3.3□□□□□ -1.88
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USP15-218ENST00000552346 PMS2P3Q13401 168 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 TPBGQ13641 420 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 BSXQ3C1V8 233 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.3□□□□□ -1.88
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USP15-218ENST00000552346 Q5W150 140 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 Q6ZR03 302 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 SLC34A3Q8N130 599 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 SPICQ8N5J4 248 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 Q8N7P7 452 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 IFT81Q8WYA0 676 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 TMEM159Q96B96 161 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 LRRC45Q96CN5 670 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 NDEL1Q9GZM8 345 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 DYSFO75923 2080 aa3.3□□□□□ -1.88
USP15-218ENST00000552346 KIAA0232Q92628 1395 aa3.29□□□□□ -1.88
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