RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533079.5

CAPN1-223, Transcript of calpain 1, human

TSL 3

Gene CAPN1, Length 878 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPN1-223	ENST00000533079	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CAPN1-223	ENST00000533079	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CAPN1-223	ENST00000533079	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CAPN1-223	ENST00000533079	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CAPN1-223	ENST00000533079	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	IRGM	A1A4Y4	181 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079		A6NLC8	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SOX14	O95416	240 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CDK1	P06493	297 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	GRK5	P34947	590 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	PRSS12	P56730	875 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	PCK2	Q16822	640 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	LNX2	Q8N448	690 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	OR2T33	Q8NG76	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	MUL1	Q969V5	352 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SSX3	Q99909	188 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	FN3K	Q9H479	309 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	RERGL	Q9H628	205 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079		F5H5K5	113 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079		K7EIL1	84 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CDC42EP2	O14613	210 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	NDUFB3	O43676	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	NDUFB2	O95178	105 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	PPP1R3D	O95685	299 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	LCAT	P04180	440 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	FAH	P16930	419 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CD33	P20138	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	DCK	P27707	260 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TMBIM6	P55061	237 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TPTE	P56180	551 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	KLRD1	Q13241	179 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TMED1	Q13445	227 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	IRF3	Q14653	427 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SNAPC1	Q16533	368 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	WDR38	Q5JTN6	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	OTP	Q5XKR4	325 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	NUAK2	Q9H093	628 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079		M0R135	149 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	BHLHE40	O14503	412 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	PRODH	O43272	600 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	IDH3B	O43837	385 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	PRKY	O43930	277 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	ENTPD6	O75354	484 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	GRP	P07492	148 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	GPR4	P46093	362 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CD69	Q07108	199 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	ST3GAL4	Q11206	333 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	KLHL22	Q53GT1	634 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CORO6	Q6QEF8	472 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079		Q8N2B8	174 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	RORB	Q92753	470 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	RFK	Q969G6	155 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	OR52D1	Q9H346	318 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CAPN1-223	ENST00000533079		A0A1W2PRD5	423 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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