RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 MT-CO3P00414 261 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-9P01782 118 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 IGHEP01854 428 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 NPBWR1P48145 328 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 GPR176Q14439 515 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PCOLCEQ15113 449 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RNF151Q2KHN1 245 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PLA1AQ53H76 456 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM205Q6UW68 189 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR52N5Q8NH56 324 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR8B4Q96RC9 309 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 LRP12Q9Y561 859 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR2M5A3KFT3 312 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 LIPT2A6NK58 231 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TNFSF11O14788 317 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OGG1O15527 345 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PTHLHP12272 177 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF84P51523 738 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CXADRP78310 365 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FHL1Q13642 323 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 HES3Q5TGS1 186 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC107Q8WV48 283 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PGAM5Q96HS1 289 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RNF2Q99496 336 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ROS1P08922 2347 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 A0A087WV48 116 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf51A6NDU8 294 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FAM166BA8MTA8 275 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF35P13682 527 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FHITP49789 147 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SELENOVP59797 346 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 DGCR2P98153 550 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 RAB11BQ15907 218 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SSX7Q7RTT5 188 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR2M3Q8NG83 312 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD1Q96SE0 405 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 VPS25Q9BRG1 176 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SEC11CQ9BY50 192 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 GPR173Q9NS66 373 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.95□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 GJE1A6NN92 205 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 G3V3Q6 166 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL13O43927 109 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CA11O75493 328 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 UBL3O95164 117 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MT-ND4P03905 459 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 UMODP07911 640 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 COX6A1P12074 109 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FGF7P21781 194 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 S100A7P31151 101 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 GGTLC2Q14390 218 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM244Q5VVB8 128 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 SPINK14Q6IE38 97 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 TMUB2Q71RG4 321 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 CDC20BQ86Y33 519 aa6.94□□□□□ -1.3
TRPS1-208ENST00000519076 FGGYQ96C11 551 aa6.94□□□□□ -1.3
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