RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A0G2JMP0 313 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A0X1KG70 313 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMC2O95347 1197 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 MSR1P21757 451 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 PAFAH1B2P68402 229 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRKCDQ05655 676 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR5T3Q8NGG3 340 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR6K6Q8NGW6 343 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 YIPF5Q969M3 257 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 TM2D3Q9BRN9 247 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM100Q9NV29 134 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF391Q9UJN7 358 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPIL1Q9Y3C6 166 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 NID2Q14112 1375 aa2.47□□□□□ -2.01
RNU6-334P-201ENST00000517072 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGKV1-39P01597 117 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGKV1D-39P04432 117 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 P0C880 135 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 PEX19P40855 299 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 CSKP41240 450 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 GRB2P62993 217 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ST3GAL4Q11206 333 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPIN3Q5JUX0 258 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR2M7Q8NG81 312 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZFAND1Q8TCF1 268 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ING5Q8WYH8 240 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR8D1Q8WZ84 308 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 MS4A8Q9BY19 250 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 CA10Q9NS85 328 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLF12Q9Y4X4 402 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC22A7Q9Y694 548 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 HIVEP2P31629 2446 aa2.46□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 FSTL3O95633 263 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGLV6-57P01721 117 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 HLA-GP17693 338 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSMB2P49721 201 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 RGS6P49758 472 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATP5G2Q06055 141 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 DOC2AQ14183 400 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 VTCN1Q7Z7D3 282 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 LINC00523Q86TU6 105 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 PDPNQ86YL7 162 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRRC8AQ8IWT6 810 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 CYB561A3Q8NBI2 242 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ORAOV1Q8WV07 137 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 BAALCQ8WXS3 180 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 HGDQ93099 445 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 YIPF6Q96EC8 236 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF649Q9BS31 505 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 C6orf50Q9HD87 102 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 INIPQ9NRY2 104 aa2.45□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR4Q2P0C623 313 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRKACAP17612 351 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 TUBG1P23258 451 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 CFHR2P36980 270 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 BCAP31P51572 246 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 HCCSP53701 268 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR12D2P58182 307 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 CPTPQ5TA50 214 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM131AQ6UXB0 335 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRP11Q86VZ4 500 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM184AQ8NB25 1140 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 TUBG2Q9NRH3 451 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF229Q9UJW7 825 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 CFL2Q9Y281 166 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIAA1671Q9BY89 1806 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 SVILO95425 2214 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 IZUMO1RA6ND01 250 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 H7C2Y5 167 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 J3QT63 122 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 NRASP01111 189 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 HRASP01112 189 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRASP01116 189 aa2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms