RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464		A0A1B0GVI7	797 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	METTL15	A6NJ78	407 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SNTN	A6NMZ2	147 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CDIPT	O14735	213 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	NDUFB3	O43676	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SULT1C4	O75897	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	MMP9	P14780	707 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ACTC1	P68032	377 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ACTA1	P68133	377 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC34A1	Q06495	639 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CDON	Q4KMG0	1287 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TTC23	Q5W5X9	447 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464		Q6YL49	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	WDR86	Q86TI4	376 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CYGB	Q8WWM9	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	MED30	Q96HR3	178 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464		Q96MT0	163 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ADI1	Q9BV57	179 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	AMBN	Q9NP70	447 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR5B21	A6NL26	309 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	IGHA1	P01876	353 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	EGR1	P18146	543 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CAPG	P40121	348 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GNG3	P63215	75 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	WDR38	Q5JTN6	314 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	STUM	Q69YW2	141 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	COMMD2	Q86X83	199 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	NRG4	Q8WWG1	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	PIGC	Q92535	297 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RORB	Q92753	470 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF170	Q96K19	258 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SLITRK2	Q9H156	845 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GNG8	Q9UK08	70 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464		A0A1B0GTI1	187 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DAPL1	A0PJW8	107 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DHRS3	O75911	302 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	IGHV1-69	P01742	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CRYBA1	P05813	215 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GNAO1	P09471	354 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CCL1	P22362	96 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TGM4	P49221	684 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CSNK2B	P67870	215 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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