RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 ISPDA4D126 451 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 RCBTB2O95199 551 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV2-8P01709 118 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 RPN2P04844 631 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1CAP62136 330 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TRDNQ13061 729 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 CDNFQ49AH0 187 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 EPGNQ6UW88 154 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 HINT2Q9BX68 163 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 COA1Q9GZY4 146 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ACOT9Q9Y305 439 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 SCN1AP35498 2009 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZMPSTE24O75844 475 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TNNC1P63316 161 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 DMC1Q14565 340 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 MAPRE2Q15555 327 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 CCL15Q16663 113 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TTC32Q5I0X7 151 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 OR5M1Q8NGP8 315 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 NT5CQ8TCD5 201 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF302Q9NR11 478 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 PPIL1Q9Y3C6 166 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 SMARCA2P51531 1590 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 NACADO15069 1562 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TVP23AA6NH52 213 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 M0R1B8 84 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 CD9P21926 228 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 DNASE1L1P49184 302 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ADIGQ0VDE8 80 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 AK9Q5TCS8 1911 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TCAPO15273 167 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 IL3RAP26951 378 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 GPR4P46093 362 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 HADHBP55084 474 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 DSTNP60981 165 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 DOK4Q8TEW6 326 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 S100PBPQ96BU1 408 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 CTRCQ99895 268 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ORC6Q9Y5N6 252 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ENPP4Q9Y6X5 453 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 S4R3C0 116 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 NESP48681 1621 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 A8MWL6 223 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-212ENST00000491302 SC5DO75845 299 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 MAS1P04201 325 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 LIPCP11150 499 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 CCL2P13500 99 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 PAX6P26367 422 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 PMELP40967 661 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R43P59537 309 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS8Q16651 343 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF709Q8N972 641 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-212ENST00000491302 CIB1Q99828 191 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 COPS4Q9BT78 406 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 TMED9Q9BVK6 235 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 PORCNQ9H237 461 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 PRORYQ9H606 182 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF835Q9Y2P0 537 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRL1O94910 1474 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 COLCA2A8K830 154 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 K7EN84 100 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 RBBP9O75884 186 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF286BP0CG31 522 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY2P41231 377 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF616Q08AN1 781 aa4.47□□□□□ -1.69
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