RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 PRSS37A4D1T9 235 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 FSTP19883 344 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 CD38P28907 300 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 SLC35A1P78382 337 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 PTX4Q96A99 478 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 ADAM19Q9H013 955 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 CA14Q9ULX7 337 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 RTTNQ86VV8 2226 aa11.9□□□□□ -0.5
NISCH-212ENST00000488380 TLCD2A6NGC4 264 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 H3BMH7 237 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 IFNA21P01568 189 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 IGKV3-11P04433 115 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 HEXBP07686 556 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 CFHR1Q03591 330 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 UBE2V2Q15819 145 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 NTNG2Q96CW9 530 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PR77 199 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 OR5H15A6NDH6 313 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 OR5H1A6NKK0 313 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 XRCC2O43543 280 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 CXCL1P09341 107 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 GLI4P10075 376 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 G0S2P27469 103 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ASCL1P50553 236 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SPCS3P61009 180 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 COMMD1Q8N668 190 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 OR52N5Q8NH56 324 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 Q8WTZ3 238 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 R4GMQ9 66 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 C2orf72A6NCS6 295 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 H0YIG0 161 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SYT7O43581 403 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 DIRAS3O95661 229 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 DANCRP0C864 163 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 FPR2P25090 351 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 OR1L3Q8NH93 324 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 GPER1Q99527 375 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 MUC3AQ02505 3323 aa11.89□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PP11 408 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 H3BQ15 152 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 CYTIPO60759 359 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 GLO1Q04760 184 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 LANCL3Q6ZV70 420 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 Q7L0L9 218 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 RNF144BQ7Z419 303 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 NAXEQ8NCW5 288 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 LIPHQ8WWY8 451 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 C8orf44Q96CB5 159 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 RAB39BQ96DA2 213 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 MUCL1Q96DR8 90 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SLC46A1Q96NT5 459 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WZY1 265 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 LILRA5A6NI73 299 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 H2BFMP0C1H6 154 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 KLK2P20151 261 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ACY1Q03154 408 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ROM1Q03395 351 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 HAGHQ16775 308 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 SYT13Q7L8C5 426 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 LYPD6BQ8NI32 183 aa11.88□□□□□ -0.51
NISCH-212ENST00000488380 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms