RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	CENPBD1	B2RD01	187 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PFDN6	O15212	129 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	YKT6	O15498	198 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	ZW10	O43264	779 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	TRAPPC3	O43617	180 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	UTS2	O95399	124 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CRYZL1	O95825	349 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SERPINE2	P07093	398 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PAEP	P09466	180 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CT45A6	P0DMU7	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	FOLR1	P15328	257 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF17	P17021	662 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF30	P17039	623 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	OMG	P23515	440 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	EVI2B	P34910	448 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PHB	P35232	272 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SLC1A2	P43004	574 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CBX5	P45973	191 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	BCAP31	P51572	246 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MAP3K7CL	P57077	242 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CARD18	P57730	90 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	NCALD	P61601	193 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SP4	Q02446	784 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	RAD51	Q06609	339 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	GNA13	Q14344	377 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	NCF4	Q15080	339 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MOG	Q16653	247 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	C4orf22	Q6V702	233 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SPATA24	Q86W54	205 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MDS2	Q8NDY4	140 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	GPX8	Q8TED1	209 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	NRBF2	Q96F24	287 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	OPALIN	Q96PE5	141 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PTPRD	P23468	1912 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	COL6A5	A8TX70	2615 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SULT1B1	O43704	296 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	ATP5H	O75947	161 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CIAO1	O76071	339 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	OR5F1	O95221	314 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	KRT75	O95678	551 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	OTC	P00480	354 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	HLA-H	P01893	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MGMT	P16455	207 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PRKACA	P17612	351 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MSR1	P21757	451 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	HAAO	P46952	286 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	UBE2A	P49459	152 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	ETV1	P50549	477 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CLDN18	P56856	261 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	SLC7A9	P82251	487 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MXD1	Q05195	221 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	REG3A	Q06141	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MGAT3	Q09327	533 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PON3	Q15166	354 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	PSG5	Q15238	335 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	STK11	Q15831	433 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	IFT20	Q8IY31	132 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	NATD1	Q8N6N6	113 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF216-208	ENST00000479541	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91

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