RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB22A	Q9UL26	194 aa		10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RGS5	O15539	181 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	LILRA1	O75019	489 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ELK1	P19419	428 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CA6	P23280	308 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	COL8A1	P27658	744 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	POU3F4	P49335	361 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ART1	P52961	327 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP5C	P53041	499 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	EFNB3	Q15768	340 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ELP2	Q6IA86	826 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF170	Q96K19	258 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51I2	Q9H344	312 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SIAH2	O43255	324 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	AKR7A2	O43488	359 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	HPGDS	O60760	199 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SCGN	O76038	276 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRM2	P08172	466 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	BMP4	P12644	408 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CFHR2	P36980	270 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	NR4A2	P43354	598 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS12	P56730	875 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN12	P56749	244 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	IL24	Q13007	206 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB12	Q6IQ22	244 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZR03	302 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DIRC2	Q96SL1	478 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GPER1	Q99527	375 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM221A	A4D161	298 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	FABP12	A6NFH5	140 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF732	B4DXR9	585 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529		E7EQL1	145 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4A8	P0C604	315 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINF1	P36955	418 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CD200	P41217	278 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	P2RY14	Q15391	338 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	AWAT2	Q6E213	333 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MKX	Q8IYA7	352 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8S1	Q8NH09	359 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CST11	Q9H112	138 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL9	Q9H1A3	318 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.85	□□□□□ -0.67

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