RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466638.5

PNCK-222, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 2

Gene PNCK, Length 1,204 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-222	ENST00000466638	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	AVP	P01185	164 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	IFNA2	P01563	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	MYL12A	P19105	171 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	HAAO	P46952	286 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	AQP3	Q92482	292 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	CHST5	Q9GZS9	411 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638		E9PI62	339 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TMPRSS2	O15393	492 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	SERPINA3	P01011	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF20	P17024	532 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	GLRA1	P23415	457 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	NPY4R	P50391	375 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	GGH	Q92820	318 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	C10orf35	Q96D05	121 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TMEM80	Q96HE8	168 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638		H0YJX3	145 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638		J3QT63	122 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	XPNPEP2	O43895	674 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	CCDC159	P0C7I6	412 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ADRA2C	P18825	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TGM4	P49221	684 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	MED21	Q13503	144 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	FGGY	Q96C11	551 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	CCL13	Q99616	98 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	SYNGR1	O43759	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ZFPL1	O95159	310 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	PAX2	Q02962	417 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	STUM	Q69YW2	141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	OPN4	Q9UHM6	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PNCK-222	ENST00000466638		A0A1B0GW55	424 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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