RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 REEP6Q96HR9 211 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 PRRC1Q96M27 445 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 CGREF1Q99674 301 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 C1orf21Q9H246 121 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 FN3KQ9H479 309 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.29□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM210A6NLX4 147 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 TBX1O43435 398 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 HLA-DQA2P01906 255 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 TK1P04183 234 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 GP9P14770 177 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 ACKR3P25106 362 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 FHL3Q13643 280 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 TRAM2Q15035 370 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 AGKQ53H12 422 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 EPGNQ6UW88 154 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 TCF23Q7RTU1 214 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 SATL1Q86VE3 508 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF561Q8N587 486 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF488Q96MN9 340 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 OR8B4Q96RC9 309 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 KCNJ15Q99712 375 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 OR51I2Q9H344 312 aa9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
DDX39B-208ENST00000428098 TNCP24821 2201 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 OR6C68A6NDL8 312 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SERPINE3A8MV23 424 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SLC25A17O43808 307 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 MMP23AO75900 390 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 RBP4P02753 201 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 HTR1DP28221 377 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 BRS3P32247 399 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 INSL3P51460 131 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 GPM6AP51674 278 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SLC7A2P52569 658 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 TIGD6Q17RP2 521 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 FAM27D1Q5T7N8 215 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 COMMD1Q8N668 190 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 OR4K13Q8NH42 304 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 COPS4Q9BT78 406 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 CENPMQ9NSP4 180 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 DPM3Q9P2X0 92 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 MUC4Q99102 2169 aa9.27□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 TVP23AA6NH52 213 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 M0QZK8 103 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 CCRL2O00421 344 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 STX1BP61266 288 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 IL18R1Q13478 541 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 HAGHQ16775 308 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 AQP3Q92482 292 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 PIGCQ92535 297 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SPATA25Q9BR10 227 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 KIAA1456Q9P272 454 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.26□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SLC1A7O00341 560 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 CST4P01036 141 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 PYCR1P32322 319 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 RPS6KA3P51812 740 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 TAF13Q15543 124 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SNAPC1Q16533 368 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 10.7
DDX39B-208ENST00000428098 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-208ENST00000428098 TEX38Q6PEX7 206 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms