RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423945.5

SBDSP1-202, Transcript of SBDS, ribosome maturation factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SBDSP1, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ST8SIA4Q92187 359 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 RNFT2Q96EX2 444 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 JMJD8Q96S16 334 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF222Q9UK12 451 aa14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 H3BSH0 61 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 TRIM77I1YAP6 450 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ATP6V1E1P36543 226 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 DGUOKQ16854 277 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 CDONQ4KMG0 1287 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.73□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 DLGAP1O14490 977 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 SYNGR1O43759 233 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 LIPFP07098 398 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 GLRA1P23415 457 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 IKZF1Q13422 519 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 LGALS12Q96DT0 336 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF488Q96MN9 340 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 WDFY2Q96P53 400 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 DUX5Q96PT3 197 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 NLKQ9UBE8 527 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 GNG8Q9UK08 70 aa14.72□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 OR2AT4A6NND4 320 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 TOX4O94842 621 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 PSG2P11465 335 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 OR12D2P58182 307 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 ARF6P62330 175 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 RDH10Q8IZV5 341 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 POC1AQ8NBT0 407 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.71□□□□□ -0.05
SBDSP1-202ENST00000423945 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM89A2RUT3 159 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 J3QT63 122 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 SIGLEC5O15389 551 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 NDUFB3O43676 98 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 HAAOP46952 286 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF91Q05481 1191 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 UBE2V2Q15819 145 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 CALHM1Q8IU99 346 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 APH1BQ8WW43 257 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF649Q9BS31 505 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.7□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 A0A1B0GVI7 797 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC16A6O15403 523 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 SYT7O43581 403 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 BAG2O95816 211 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 PGA5P0DJD9 388 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 PRTN3P24158 256 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 MPZP25189 248 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ACTG1P63261 375 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ACTC1P68032 377 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 ACTA1P68133 377 aa14.69□□□□□ -0.06
SBDSP1-202ENST00000423945 IL13RA1P78552 427 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms