RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409483.5

PTPRN2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-205ENST00000409483 HPNP05981 417 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ABHD3Q8WU67 409 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 PIN1P1O15428 100 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF266Q14584 549 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 FAM122BQ7Z309 247 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 TAAR9Q96RI9 348 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 FZR1Q9UM11 496 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 MGAMO43451 1857 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ADAM11O75078 769 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF250P15622 560 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 TBPP20226 339 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 RAB32Q13637 225 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 LCN15Q6UWW0 184 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 C14orf79Q96F83 325 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 C9orf170A2RU37 121 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 KCNAB3O43448 404 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 LIMK1P53667 647 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 RAG2P55895 527 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 TMEM123Q8N131 208 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 OR6X1Q8NH79 312 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 HLA-DQB1P01920 261 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 DRAM2Q6UX65 266 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 MRGPREQ86SM8 312 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 PFDN5Q99471 154 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRN2-205ENST00000409483 VWA8A3KMH1 1905 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 BCL2L11O43521 198 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 RECKO95980 971 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 AADACP22760 399 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 CA6P23280 308 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 ECI1P42126 302 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 RAB31Q13636 194 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 VSIG8P0DPA2 414 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 RAB35Q15286 201 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 ISXQ2M1V0 245 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 KIF25Q9UIL4 384 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 FUT6P51993 359 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 HBG1P69891 147 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 HBG2P69892 147 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 DMWDQ09019 674 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SCMH1Q96GD3 660 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 TCFL5Q9UL49 500 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 MPPED1O15442 326 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 ONECUT2O95948 504 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 FUT3P21217 361 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 CLLU1Q5K131 121 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 OR8U1Q8NH10 309 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 JTBO76095 146 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SULT1A3P0DMM9 295 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SULT1A4P0DMN0 295 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 ARR3P36575 388 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF573Q86YE8 665 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 GPX8Q8TED1 209 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 CT55Q8WUE5 264 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 DYRK2Q92630 601 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 CXorf58Q96LI9 332 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 GHRLQ9UBU3 117 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 MT-CO3P00414 261 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 RAB11AP62491 216 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 CARFQ8N187 725 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms