RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383974.1

RNU6-1040P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1040, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1040P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FADS3Q9Y5Q0 445 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ROS1P08922 2347 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SSPOA2VEC9 5147 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRGV2A0A075B6R0 118 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GMNCA6NCL1 334 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ODF3BA8MYP8 253 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ANKRD65E5RJM6 399 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 F5H5T6 163 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 H0YCG3 227 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 K7ERS5 55 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ISLRO14498 428 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ETHE1O95571 254 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GABRG2P18507 467 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CTAG1AP78358 180 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ADIGQ0VDE8 80 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SELENBP1Q13228 472 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR1Q1Q15612 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC8B1Q6J4K2 584 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RUFY3Q7L099 469 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC16A14Q7RTX9 510 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 WDR31Q8NA23 367 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF738Q8NE65 137 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR5AR1Q8NGP9 310 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR5H2Q8NGV7 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM19A4Q96LR4 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF251Q9BRH9 671 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 THTPAQ9BU02 230 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PISDQ9UG56 409 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NAGKQ9UJ70 344 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 H7C0C1 242 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NDUFAB1O14561 156 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CLOCKO15516 846 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR2J3O76001 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HBE1P02100 147 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GLRA2P23416 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ATP5OP48047 213 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 INCA1Q0VD86 236 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BST1Q10588 318 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC00303Q3SY05 128 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PYCR3Q53H96 274 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ACSBG2Q5FVE4 666 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TCAIMQ8N3R3 496 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MFSD8Q8NHS3 518 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BAALCQ8WXS3 180 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DYNLL2Q96FJ2 89 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRRC1Q96M27 445 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BEX1Q9HBH7 125 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CLN6Q9NWW5 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ENPP4Q9Y6X5 453 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PXDNLA1KZ92 1463 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FNDC10F2Z333 226 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TP53I11O14683 189 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CTNSO60931 367 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPAG6O75602 509 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SERPINA3P01011 423 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CTLA4P16410 223 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PSMB9P28065 219 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IL24Q13007 206 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CASP8Q14790 479 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TNXAQ16473 311 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BCL2A1Q16548 175 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 STEAP4Q687X5 459 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C22orf42Q6IC83 251 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CLEC18BQ6UXF7 455 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC22A9Q8IVM8 553 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MUC15Q8N387 334 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLC25A45Q8N413 288 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ORAOV1Q8WV07 137 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RXFP2Q8WXD0 754 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RHOFQ9HBH0 211 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM165Q9HC07 324 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TREX1Q9NSU2 369 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR5V1Q9UGF6 321 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 JCADQ9P266 1359 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NCKAP5O14513 1909 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LCTP09848 1927 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SLIT2O94813 1529 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A0A0J9YYE9 177 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C9JQL5 133 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OXTP01178 125 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRBC1P01850 177 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HLA-GP17693 338 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RRM2P31350 389 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RAB10P61026 200 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF33AQ06730 810 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPIN4Q56A73 249 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms