RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 A0A1W2PRM7 423 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 GPR137BO60478 399 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 IGLV3-1P01715 115 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 PSG2P11465 335 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 FAHP16930 419 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 CAV3P56539 151 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 EFNB1P98172 346 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 GUCA2AQ02747 115 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 TCEANCQ8N8B7 351 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 WFDC12Q8WWY7 111 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 AQP3Q92482 292 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.68□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 NPFFO15130 113 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 KCNAB3O43448 404 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 MITFO75030 526 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 DHRS3O75911 302 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 FBP1P09467 338 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 EPHA2P29317 976 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 CXCR4P61073 352 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 KLRD1Q13241 179 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 AADACL4Q5VUY2 407 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 TNFRSF14Q92956 283 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 APOL4Q9BPW4 351 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 PRRG3Q9BZD7 231 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 KRT84Q9NSB2 600 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ENPP5Q9UJA9 477 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.67□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 A0A1W2PQ09 198 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 OR5B21A6NL26 309 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 G3V2T6 193 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 M0R129 80 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 M0R1W7 72 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 NRASP01111 189 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 TTRP02766 147 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 UBE2E1P51965 193 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ACTR3P61158 418 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ATP6AP1Q15904 470 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 TAF9Q16594 264 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 PNKDQ8N490 385 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 LINC01006Q8NI28 216 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 CITED1Q99966 193 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZNF222Q9UK12 451 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 RNF114Q9Y508 228 aa11.66□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 MEIOCA2RUB1 952 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZAR1LA6NP61 321 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP10-3P60369 221 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 BNIP1Q12981 228 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 BLMHQ13867 455 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 BRICD5Q6PL45 260 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 TMEM163Q8TC26 289 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 SDSLQ96GA7 329 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 IL4I1Q96RQ9 567 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 RASL12Q9NYN1 266 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 OR52A1Q9UKL2 312 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 R4GMQ9 66 aa11.65□□□□□ -0.54
NELFE-201ENST00000375425 VWFP04275 2813 aa11.65□□□□□ -0.55
NELFE-201ENST00000375425 BTBD17A6NE02 478 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-201ENST00000375425 A6NIN4 97 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-201ENST00000375425 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-201ENST00000375425 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-201ENST00000375425 PAHP00439 452 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-201ENST00000375425 FASP25445 335 aa11.64□□□□□ -0.55
NELFE-201ENST00000375425 SAA4P35542 130 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms