RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368460.7

PBXIP1-201, Transcript of PBX homeobox interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene PBXIP1, Length 1,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBXIP1-201ENST00000368460 LRP12Q9Y561 859 aa14.93□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 TNFRSF11BO00300 401 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 SEMG1P04279 462 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 GSTT1P30711 240 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 OPRL1P41146 370 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 RAB13P51153 203 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 COMMD2Q86X83 199 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 Q8N2B8 174 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 OR2T27Q8NH04 317 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 PIFOQ8TCI5 191 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 SDSLQ96GA7 329 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF222Q9UK12 451 aa14.92□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 VGLL3A8MV65 326 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 H3BUI4 141 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 CCNB2O95067 398 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 SOX14O95416 240 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 ARG1P05089 322 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 CCL3L1P16619 93 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 DCTDP32321 178 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 SLC35A2P78381 396 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 CEP78Q5JTW2 689 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 THEM6Q8WUY1 208 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.91□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 MEGF11A6BM72 1044 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 RFPL4AA6NLU0 287 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 K7EIL1 84 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 F2RL2O00254 374 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 GASTP01350 101 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 LYNP07948 512 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 MAP2K3P46734 347 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 CD69Q07108 199 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 SSX2Q16385 188 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF561Q8N587 486 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 AMELYQ99218 206 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 OR51I2Q9H344 312 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 MED20Q9H944 212 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 RASL12Q9NYN1 266 aa14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PBXIP1-201ENST00000368460 A6NDX4 124 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 OR5B21A6NL26 309 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 FAM183AA6NL82 134 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 CLIC3O95833 236 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 OR12D2P58182 307 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 MOB3CQ70IA8 216 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 MALSU1Q96EH3 234 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 OR51V1Q9H2C8 321 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa14.89□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 ARPC2O15144 300 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 GSC2O15499 205 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 PRDX2P32119 198 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 AQP3Q92482 292 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 DPF1Q92782 380 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 LYZL4Q96KX0 146 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 NIPAL2Q9H841 368 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 CMC2Q9NRP2 79 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.88□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 E9PQ18 207 aa14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 NXPH2O95156 264 aa14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 CBX1P83916 185 aa14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 ZNF273Q14593 569 aa14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.87□□□□□ -0.03
PBXIP1-201ENST00000368460 CD177Q8N6Q3 437 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms