RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF726A6NNF4 738 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 TNFSF11O14788 317 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV2-5P01817 119 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF44P15621 663 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 TBPP20226 339 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 NFYBP25208 207 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 CLDN17P56750 224 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 IL13RA1P78552 427 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 DCAF10Q5QP82 559 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 OR14L1PQ8NHC6 308 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 MALSU1Q96EH3 234 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 VSIG4Q9Y279 399 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 PINLYPA6NC86 204 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 H3BSH0 61 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 M0QYG6 137 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 FSTP19883 344 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 MFAP5Q13361 173 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 HIST3H3Q16695 136 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 OR10K2Q6IF99 312 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 DCUN1D4Q92564 292 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 NKD1Q969G9 470 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 UCN2Q96RP3 112 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SLC6A7Q99884 636 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 LRFN1Q9P244 771 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 R4GMQ9 66 aa16.37■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 MEGF11A6BM72 1044 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 GJE1A6NN92 205 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 CCSO14618 274 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 F12P00748 615 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SFTA3P0C7M3 94 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R1AQ13522 171 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 ABHD17BQ5VST6 288 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SPINK14Q6IE38 97 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SRXN1Q9BYN0 137 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SPTBN2O15020 2390 aa16.36■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0B4J2A0 478 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 TAAR5O14804 337 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO24O75426 580 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 FTH1P19P0C7X4 201 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 RAB6AP20340 208 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 ITGA3P26006 1051 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 TMED6Q8WW62 240 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 WNT2BQ93097 391 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 AQP10Q96PS8 301 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 DNAJB11Q9UBS4 358 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SHPKQ9UHJ6 478 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 DCDC2BA2VCK2 349 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 NEURL1O76050 574 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 VAMP5O95183 116 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 FARS2O95363 451 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 QDPRP09417 244 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 FOXO1Q12778 655 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 FAM76BQ5HYJ3 339 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 IL22RA1Q8N6P7 574 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 C14orf79Q96F83 325 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 IP6K3Q96PC2 410 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 MICU1Q9BPX6 476 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SELENOIQ9C0D9 397 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 CST11Q9H112 138 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 CKLFQ9UBR5 152 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 EMC9Q9Y3B6 208 aa16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 LDLRAD4O15165 306 aa16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 H2BFMP0C1H6 154 aa16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 HTR2CP28335 458 aa16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 CDAP32320 146 aa16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 GABREP78334 506 aa16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 PMPCAQ10713 525 aa16.34■□□□□ 0.21
SPNS1-204ENST00000352260 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms