RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 TGFBR3Q03167 851 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 GABRA6Q16445 453 aa15.43■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.43■□□□□ 0.06
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ACTB-201ENST00000331789 OR14I1A6ND48 311 aa15.42■□□□□ 0.06
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ACTB-201ENST00000331789 GABRR1P24046 479 aa15.42■□□□□ 0.06
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ACTB-201ENST00000331789 PDZK1IP1Q13113 114 aa15.42■□□□□ 0.06
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ACTB-201ENST00000331789 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.42■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.42■□□□□ 0.06
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ACTB-201ENST00000331789 MEF2DQ14814 521 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 CALHM1Q8IU99 346 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 ST8SIA4Q92187 359 aa15.41■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.41■□□□□ 0.06
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ACTB-201ENST00000331789 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 OR51F2Q8NH61 342 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 FBXW5Q969U6 566 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 ABHD17AQ96GS6 310 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.4■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
ACTB-201ENST00000331789 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
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ACTB-201ENST00000331789 TNFSF13O75888 250 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 NAT1P18440 290 aa15.39■□□□□ 0.05
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ACTB-201ENST00000331789 GPR137Q96N19 417 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 LILRA1O75019 489 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 AGFG2O95081 481 aa15.39■□□□□ 0.05
ACTB-201ENST00000331789 CRYABP02511 175 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
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