RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 A6NIN4 97 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYT7O43581 403 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCN1Q15293 331 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD276Q5ZPR3 534 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5T2Q8NGG2 359 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNTG1Q9NSN8 517 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJB11Q9UBS4 358 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF69Q9UC07 566 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANK2Q01484 3957 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV40A0A0B4J280 105 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PQLC2LA1A4F0 135 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFF1P04155 84 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLRA1P23415 457 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR12D2P58182 307 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF12P61328 243 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST8SIA4Q92187 359 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q96MT0 163 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMBNQ9NP70 447 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD61A6NGH8 418 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHA1P01876 353 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELLP14151 372 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 FPR2P25090 351 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX2P28328 305 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGM4P49221 684 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPCAT4Q643R3 524 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 FDX2Q6P4F2 183 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTN2A1Q7KYR7 527 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAFA1Q96PS6 74 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNTTIP1Q9H147 329 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLKQ9UBE8 527 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKX6-3A6NJ46 265 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF879B4DU55 563 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3QT63 122 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNGR1O43759 233 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 WBP4O75554 376 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLATP00750 562 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAAOP46952 286 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTA2P62736 377 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTG2P63267 376 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 IKZF1Q13422 519 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf91Q3C1V1 193 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF788Q6ZQV5 615 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 RDH10Q8IZV5 341 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 POC1AQ8NBT0 407 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC54Q8NEL0 328 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF671Q8TAW3 534 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PELI1Q96FA3 418 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf36Q96KX1 117 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF488Q96MN9 340 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF649Q9BS31 505 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG8Q9BVK2 526 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHST5Q9GZS9 411 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESM1Q9NQ30 184 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRRS1LQ9P0K9 344 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF222Q9UK12 451 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2AT4A6NND4 320 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPFP07098 398 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFTPBP07988 381 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP9P14780 707 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB40BQ12829 278 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 DGUOKQ16854 277 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHFPL3Q86UP9 236 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF573Q86YE8 665 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFAND2BQ8WV99 257 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMIGD2Q96BF3 282 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBX15Q96SF7 602 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADI1Q9BV57 179 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIRPDQ9H106 197 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3QLW9 94 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIGLEC5O15389 551 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFB3O43676 98 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms