RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326197.11

SCMH1-201, Transcript of Scm polycomb group protein homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCMH1, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1-201ENST00000326197 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SDK2Q58EX2 2172 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 POU2F2P09086 479 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FAHP16930 419 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF43P17038 809 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 DEFA6Q01524 100 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RHEBQ15382 184 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MUC3AQ02505 3323 aa8.94□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TLCD2A6NGC4 264 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 NPIPB7O75200 414 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LY86O95711 162 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 HPNP05981 417 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR5H8P0DN80 308 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 GABRG2P18507 467 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 GNMTQ14749 295 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 AADACL3Q5VUY0 350 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR5AS1Q8N127 324 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 E5RGE8 158 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 GPR37O15354 613 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 IGKV3-11P04433 115 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ZNF728P0DKX0 622 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SLC35A1P78382 337 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 HSD11B2P80365 405 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MFAP5Q13361 173 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TAF9Q16594 264 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 DOK3Q7L591 496 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LRRC18Q8N456 261 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PECRQ9BY49 303 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OSGIN2Q9Y236 505 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 NSG2Q9Y328 171 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 A0A1W2PQD3 144 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 QDPRP09417 244 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FOLR2P14207 255 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SNCAP37840 140 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RRADP55042 308 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 UBE2KP61086 200 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 HAGHQ16775 308 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LTBP2Q14767 1821 aa8.93□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 USP34Q70CQ2 3546 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ANGPTL7O43827 346 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 DEDDO75618 318 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 GALNSP34059 522 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RSU1Q15404 277 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 BRICD5Q6PL45 260 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 NELFAQ9H3P2 528 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RNF122Q9H9V4 155 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FAM186AA6NE01 2351 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 OR5AC1P0C628 307 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PRSS12P56730 875 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 HERV-K104P61576 105 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 VAMP2P63027 116 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 FAM3AP98173 230 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 MYBPHQ13203 477 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 PPA1Q15181 289 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 THEM4Q5T1C6 240 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 GKN2Q86XP6 184 aa8.92□□□□□ -0.98
SCMH1-201ENST00000326197 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms