RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.3□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 PRR13Q9NZ81 148 aa11.3□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 KCNK7Q9Y2U2 307 aa11.3□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 WISP2O76076 250 aa11.29□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 SCGB1D2O95969 90 aa11.29□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 PPA2Q9H2U2 334 aa11.29□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 CD276Q5ZPR3 534 aa11.29□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 GPX8Q8TED1 209 aa11.29□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.29□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 SYNGR3O43761 229 aa11.29□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 UBBP0CG47 229 aa11.29□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 S100A10P60903 97 aa11.29□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.29□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.28□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 SLC25A28Q96A46 364 aa11.28□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.28□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 CDH24Q86UP0 819 aa11.28□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 MDS2Q8NDY4 140 aa11.28□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 HSPA12AO43301 675 aa11.27□□□□□ -0.6
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HPS1-201ENST00000325103 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 SCMH1Q96GD3 660 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 M0R233 179 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 MPGP29372 298 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 SCAND1P57086 179 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 HERV-K104P61576 105 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 GHITMQ9H3K2 345 aa11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HPS1-201ENST00000325103 IL2RAP01589 272 aa11.26□□□□□ -0.61
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