RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR2C3Q8N628 320 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 Q8WTZ3 238 aa14.81□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 BORCS8Q96FH0 119 aa14.81□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.81□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 A8MXE2 369 aa14.8□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 MMP16P51512 607 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 CDC20BQ86Y33 519 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.8□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 NTF3P20783 257 aa14.8□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 GFI1Q99684 422 aa14.8□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RNF126Q9BV68 326 aa14.8□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 C4orf47A7E2U8 309 aa14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 J3QRE1 110 aa14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 UPK3AO75631 287 aa14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 TK1P04183 234 aa14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 CD5P06127 495 aa14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SLC35E2P0CK97 266 aa14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 GGTLC2Q14390 218 aa14.79□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 OR5AC1P0C628 307 aa14.79□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ATP6V0CP27449 155 aa14.79□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 HBG1P69891 147 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 MALLQ13021 153 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.78□□□□□ -0.04
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PACS1-201ENST00000320580 APODP05090 189 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RND3P61587 244 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 BSXQ3C1V8 233 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 Q6ZN92 141 aa14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PACS1-201ENST00000320580 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.78□□□□□ -0.04
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