RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 RPS25P62851 125 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
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CCDC42-201ENST00000293845 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.15□□□□□ -0.63
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CCDC42-201ENST00000293845 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.15□□□□□ -0.63
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CCDC42-201ENST00000293845 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.14□□□□□ -0.63
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CCDC42-201ENST00000293845 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa11.13□□□□□ -0.63
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CCDC42-201ENST00000293845 IL24Q13007 206 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 CEACAM19Q7Z692 300 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
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