RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
USP21-201ENST00000289865 MBD2Q9UBB5 411 aa16.77■□□□□ 0.28
USP21-201ENST00000289865 NUP50Q9UKX7 468 aa16.77■□□□□ 0.28
USP21-201ENST00000289865 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.77■□□□□ 0.28
USP21-201ENST00000289865 DHRS7CA6NNS2 312 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 C9orf172C9J069 976 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SFT2D2O95562 160 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CNR1P21554 472 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 LUMP51884 338 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PSG4Q00888 419 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 AADACL3Q5VUY0 350 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 LHFPL1Q86WI0 220 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SULF2Q8IWU5 870 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 FGFBP3Q8TAT2 258 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 C17orf50Q8WW18 174 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SPSB1Q96BD6 273 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PPA2Q9H2U2 334 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 GPR35Q9HC97 309 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PRR13Q9NZ81 148 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 LRFN1Q9P244 771 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.77■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ANGPTL7O43827 346 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PLATP00750 562 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 GFRA1P56159 465 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 FOXO1Q12778 655 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 Q96M66 194 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 MICU1Q9BPX6 476 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 DDA1Q9BW61 102 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 METTL9Q9H1A3 318 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 WNT5BQ9H1J7 359 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 FOXJ2Q9P0K8 574 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.76■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CYTIPO60759 359 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SERPINA5P05154 406 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CRHP06850 196 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 RFC3P40938 356 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 OR5AP2Q8NGF4 316 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ZNF75AQ96N20 296 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 LINC00052Q96N35 136 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 DHRS9Q9BPW9 319 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PSMB6P28072 239 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ARPC4P59998 168 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ARL6IP1Q15041 203 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 RSU1Q15404 277 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 FAM74A1Q5RGS3 127 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SPRY4Q9C004 299 aa16.75■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 LNP1A1A4G5 178 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 KCNAB3O43448 404 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ZP3P21754 424 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SKA3Q8IX90 412 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 NMES1Q9C002 83 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CA11O75493 328 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 IGHV3-9P01782 118 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 CSTBP04080 98 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PRKACBP22694 351 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 GLRA1P23415 457 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 RTL6Q6ICC9 239 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 OVCH2Q7RTZ1 564 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SLC25A32Q9H2D1 315 aa16.74■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ADAP1O75689 374 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PCBD1P61457 104 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SRYQ05066 204 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PPA1Q15181 289 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 ANKRD55Q3KP44 614 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PDSS1Q5T2R2 415 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 PLXDC2Q6UX71 529 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 BORCS8Q96FH0 119 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.73■□□□□ 0.27
USP21-201ENST00000289865 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms