RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 SLC31A2O15432 143 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TRGC2P03986 189 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FOXC1Q12948 553 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CYYR1Q96J86 154 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PARP11Q9NR21 331 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CLDN4O14493 209 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SCRG1O75711 98 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 IFNA10P01566 189 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 IL2RAP01589 272 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HEXBP07686 556 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 KLK2P20151 261 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HOXA5P20719 270 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A1P53007 311 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 BTNL8Q6UX41 500 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ARRDC1Q8N5I2 433 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MISP3Q96FF7 219 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RARRES2Q99969 163 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RARRES3Q9UL19 164 aa9.6□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 A0A0G2JNG1 304 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 A0A0J9YY10 115 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 NKX2-2O95096 273 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FXYD4P59646 89 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 KIR2DS5Q14953 304 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ACKR1Q16570 336 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 WBP2NLQ6ICG8 309 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SLC43A2Q8N370 569 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ADOQ96SZ5 270 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RAB18Q9NP72 206 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 C17orf51A8MQB3 221 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SOCS1O15524 211 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RAMP1O60894 148 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MELTFP08582 738 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CTLA4P16410 223 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HGFACQ04756 655 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CEBPEQ15744 281 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 DGAT2Q96PD7 388 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 TAAR5O14804 337 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 HKR1P10072 659 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 RPS23P62266 143 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF248Q8NDW4 579 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 ERGIC1Q969X5 290 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 REEP6Q96HR9 211 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 AQP10Q96PS8 301 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 PRRX2Q99811 253 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 POLE3Q9NRF9 147 aa9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CNGA3-201ENST00000272602 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 A0A1B0GTQ1 180 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 VSIG8P0DPA2 414 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HLA-GP17693 338 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 CCR5P51681 352 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 KHDC3LQ587J8 217 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 PMS2CLQ68D20 193 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 MED25Q71SY5 747 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 REC114Q7Z4M0 266 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SLC39A7Q92504 469 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 TAAR8Q969N4 342 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SNX22Q96L94 193 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.58□□□□□ -0.88
CNGA3-201ENST00000272602 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms