RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 CLDN15P56746 228 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF529Q6P280 563 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 DHRS13Q6UX07 377 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RHOFQ9HBH0 211 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 A0A0B4J2A0 478 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 C7orf66A4D0T2 115 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC31A2O15432 143 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CLN3Q13286 438 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SSX9Q7RTT3 188 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 NOXA1Q86UR1 476 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 NOTCH4Q99466 2003 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SPRY3O43610 288 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TCRBP04435 133 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CLDN20P56880 219 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OR1C1Q15619 314 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC35E1Q96K37 410 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OR51J1Q9H342 316 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FAM186AA6NE01 2351 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLC22A5O76082 557 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HLA-DOBP13765 273 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM230Q96A57 120 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HES4Q9HCC6 221 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OR5B21A6NL26 309 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SIRPB1O00241 398 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 P2RY10O00398 339 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CLPSP04118 112 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CEACAM1P13688 526 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 COX6B1P14854 86 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 UPK3AO75631 287 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 DHRS3O75911 302 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CSF3P09919 207 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 OMGP23515 440 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PMPCAQ10713 525 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 WDR38Q5JTN6 314 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LRP12Q9Y561 859 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 C1QCP02747 245 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 CPN1P15169 458 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF626Q68DY1 528 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 DESI1Q6ICB0 168 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 DPF1Q92782 380 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 MCHR2Q969V1 340 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 NPTNQ9Y639 398 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 F6UZH7 168 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SH2D1BO14796 132 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 HPNP05981 417 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 SMIM17P0DL12 118 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 RBP2P50120 134 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF766Q5HY98 468 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZFP82Q8N141 532 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 COPS3Q9UNS2 423 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPN3-201ENST00000262539 LNP1A1A4G5 178 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms