RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 EFNA4P52798 201 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF846Q147U1 533 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 OR8G1Q15617 311 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 CEP78Q5JTW2 689 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 PLCXD3Q63HM9 321 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 HPSE2Q8WWQ2 592 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 OR5P3Q8WZ94 311 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM30A4D0T7 59 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 NOTOA8MTQ0 251 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 ADH4P08319 380 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 PSMD7P51665 324 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 PPP3R1P63098 170 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 CEACAM21Q3KPI0 293 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 DMRTC1Q5HYR2 192 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 Q5PR19 223 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 DDI2Q5TDH0 399 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 SFXN4Q6P4A7 337 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 OR51A2Q8NGJ7 313 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 CEP19Q96LK0 163 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 DIRC2Q96SL1 478 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 MYO9AB2RTY4 2548 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD11-201ENST00000249504 CSMD1Q96PZ7 3565 aa16.52■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 SSX4O60224 188 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 NCR1O76036 304 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 F12P00748 615 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV1-46P01743 117 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 CAV3P56539 151 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 SHEQ5VZ18 495 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 LRRTM1Q86UE6 522 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 SPERTQ8NA61 448 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 OR2Z1Q8NG97 314 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 OR10AD1Q8NGE0 317 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 OR5A2Q8NGI9 324 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 OR8S1Q8NH09 359 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 SPSB1Q96BD6 273 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 CXXC4Q9H2H0 198 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 DECR2Q9NUI1 292 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 RGS5O15539 181 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 LY6HO94772 140 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 PRKACBP22694 351 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 TNFSF4P23510 183 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 BDKRB2P30411 391 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 CCL8P80075 99 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 FAM209AQ5JX71 171 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 IDNKQ5T6J7 187 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 MICU1Q9BPX6 476 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 SLC7A11Q9UPY5 501 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 CREBBPQ92793 2442 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0G2JK05 382 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 OR5B21A6NL26 309 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 F5H5P2 479 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 CTDSP2O14595 271 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 MAS1P04201 325 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 ALDOBP05062 364 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 CD55P08174 381 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 ADRA2CP18825 462 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 FUT6P51993 359 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 NR2C2APQ86WQ0 139 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 NPRL2Q8WTW4 380 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 BORCS5Q969J3 196 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 RNF170Q96K19 258 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 WDFY2Q96P53 400 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 RTL8AQ9BWD3 113 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 NEK6Q9HC98 313 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 ADAM30Q9UKF2 790 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 V9GY05 133 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 PQLC2LA1A4F0 135 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 MEGF11A6BM72 1044 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 THBS2P35442 1172 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 CD200P41217 278 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 OR10A3P58181 314 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF45Q02386 682 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 MZT1Q08AG7 82 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 MAB21L1Q13394 359 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 PRSS57Q6UWY2 283 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 OR52N4Q8NGI2 321 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXD11-201ENST00000249504 BORCS8Q96FH0 119 aa16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms